パッケージ: bitseq (0.7.5+dfsg-7)

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類似のパッケージ:

Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data

BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.

その他の bitseq 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [alpha, loong64, sh4 以外]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]

GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, i386, s390x, x32]

GCC 共有ライブラリ

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64, ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [arm64, loong64, mips64el, riscv64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC 共有ライブラリ
dep: libgomp1 (>= 6)

GCC OpenMP (GOMP) サポートライブラリ
dep: libstdc++6 (>= 11) [alpha 以外]

GNU 標準 C++ ライブラリ v3

dep: libstdc++6 (>= 14.2.0-19) [alpha]
dep: python3

対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
dep: python3-numpy

Python library for numerical computations (Python 3)
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

圧縮ライブラリ - ランタイム

sug: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

bitseq のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	350.2 kB	2,416.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	351.4 kB	2,047.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	304.6 kB	2,215.0 kB	[ファイル一覧]
armel	289.1 kB	2,074.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	291.9 kB	1,498.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	307.8 kB	1,669.0 kB	[ファイル一覧]
i386	371.7 kB	2,066.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	314.3 kB	2,215.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	314.9 kB	1,730.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	337.1 kB	2,491.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	349.8 kB	2,919.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	350.3 kB	2,599.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	336.4 kB	1,451.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	332.3 kB	2,039.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	367.8 kB	2,075.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	299.5 kB	13,449.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	354.7 kB	1,894.0 kB	[ファイル一覧]