Package: r-bioc-shortread (1.64.0-3 and others)

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classi e metodi GNU R per grosse moli di dati di sequenziamento short-read

Questo modulo BioConductor è un pacchetto per l'immissione, il controllo qualità, la manipolazione e l'emissione di grosse moli di dati di sequenziamento. ShortRead è fornito negli ambienti R e BioConductor, permettendo un pronto accesso alle funzionalità aggiuntive per l'analisi statistica avanzata, la trasformazione dei dati, la visualizzazione e l'integrazione con differenti risorse genomiche.

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dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]

dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not hppa, ia64, m68k, sparc64]

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dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sparc64]

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dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

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dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [m68k, sparc64]

libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
dep: libstdc++6 (>= 11) [not m68k, sparc64]

libreria GNU Standard C++, versione 3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

libreria per tracciare la catena di chiamate di un programma - runtime
dep: r-api-3.4 [m68k]

Package not available
dep: r-api-3.5 [sparc64]

Package not available
dep: r-api-4.0 [not m68k, sparc64]

virtual package provided by r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Package not available
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

Package not available
dep: r-api-bioc-3.20 [not hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

Package not available
dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]

nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
dep: r-bioc-biobase

funzioni base per Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)

funzioni generiche per Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel

funzionalità BioConductor per valutazione parallela
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.37.1) [m68k]

oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche

dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [not m68k]
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.19) [m68k]

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dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2) [not m68k]
dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6) [not m68k]

rappresentazione e manipolazione di allineamenti genomici corti per BioConductor

dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.5.4) [m68k]
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.6) [m68k]

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dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [not m68k]
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dep: r-bioc-iranges (>= 2.3.7) [m68k]
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Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	1.64.0-3	5,097.0 kB	8,257.0 kB	[list of files]
amd64	1.64.0-3	5,097.5 kB	8,210.0 kB	[list of files]
arm64	1.64.0-3	5,093.3 kB	8,256.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	1.60.0-2	5,064.8 kB	7,527.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	1.60.0-2	5,072.7 kB	7,620.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	1.64.0-3	5,096.0 kB	8,257.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	1.36.0-1	4,189.1 kB	6,069.0 kB	[list of files]
mips64el	1.64.0-3	5,090.3 kB	8,270.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	1.64.0-3	5,101.6 kB	8,325.0 kB	[list of files]
ppc64el	1.64.0-3	5,099.2 kB	8,320.0 kB	[list of files]
riscv64	1.64.0-3	5,095.3 kB	8,190.0 kB	[list of files]
s390x	1.64.0-3	5,095.9 kB	8,220.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	1.60.0-2	5,066.6 kB	7,494.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	1.40.0-1	4,896.8 kB	7,343.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	1.56.1-1	5,043.0 kB	7,479.0 kB	[list of files]