[ Source: r-bioc-pwalign ]
Package: r-bioc-pwalign (1.2.0-3)
Links for r-bioc-pwalign
Debian Resources:
Download Source Package r-bioc-pwalign:
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.dsc]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0.orig.tar.xz]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.debian.tar.xz]
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioconductor.org]
Similar packages:
effettua allineamenti di sequenze a coppie
Le due funzioni principali nel pacchetto sono pairwiseAlignment() e stringDist(). La prima risolve problemi di allineamento globale (Needleman- Wunsch), allineamento locale (Smith-Waterman) e allineamento di sovrapposizione (terminali liberi). La seconda calcola la distanza di edit di Levenshtein o la matrice del punteggio di allineamento a coppie per un insieme di stringhe.
Other Packages Related to r-bioc-pwalign
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
-
- dep: r-api-4.0
- virtual package provided by r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.20
- virtual package provided by r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-bioc-biocgenerics
- funzioni generiche per Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.71.5)
- oggetti stringa di GNU R che rappresentano sequenze biologiche
-
- dep: r-bioc-iranges
- contenitori a basso livello per memorizzare insiemi di intervalli di interi per GNU R
-
- dep: r-bioc-s4vectors
- implementazione di vettori e liste per BioConductor S4
-
- dep: r-bioc-xvector
- rappresentazione e manipolazione di sequenze esterne per BioConductor
-
- sug: r-cran-runit
- pacchetto GNU R che fornisce un'infrastruttura per test di unitÃ
Download r-bioc-pwalign
Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
---|---|---|---|
alpha (unofficial port) | 745.3 kB | 1,148.0 kB | [list of files] |
amd64 | 746.0 kB | 1,108.0 kB | [list of files] |
arm64 | 744.6 kB | 1,148.0 kB | [list of files] |
loong64 (unofficial port) | 744.7 kB | 1,147.0 kB | [list of files] |
mips64el | 743.0 kB | 1,156.0 kB | [list of files] |
ppc64 (unofficial port) | 748.3 kB | 1,213.0 kB | [list of files] |
ppc64el | 746.4 kB | 1,148.0 kB | [list of files] |
riscv64 | 745.4 kB | 1,092.0 kB | [list of files] |
s390x | 745.7 kB | 1,112.0 kB | [list of files] |
sparc64 (unofficial port) | 741.2 kB | 2,045.0 kB | [list of files] |