[ Source: r-bioc-pwalign ]
Paketti: r-bioc-pwalign (1.2.0-3)
Links for r-bioc-pwalign
Debian-palvelut:
Imuroi lähdekoodipaketti r-bioc-pwalign:
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.dsc]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0.orig.tar.xz]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.debian.tar.xz]
Ylläpitäjät:
External Resources:
- Kotisivu [bioconductor.org]
Samankaltaisia paketteja:
Perform pairwise sequence alignments
The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.
Muut pakettiin r-bioc-pwalign liittyvät paketit
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]
- GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb
-
- dep: r-api-4.0
- näennäispaketti, jonka toteuttaa r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.20
- näennäispaketti, jonka toteuttaa r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-bioc-biocgenerics
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.71.5)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- dep: r-bioc-iranges
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
-
- dep: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-xvector
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
Imuroi r-bioc-pwalign
| Arkkitehtuuri | Paketin koko | Koko asennettuna | Tiedostot |
|---|---|---|---|
| alpha (epävirallinen siirros) | 745.3 kt | 1,148.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| amd64 | 746.0 kt | 1,108.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| arm64 | 744.6 kt | 1,148.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| loong64 (epävirallinen siirros) | 744.7 kt | 1,147.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| mips64el | 743.0 kt | 1,156.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64 (epävirallinen siirros) | 748.3 kt | 1,213.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| ppc64el | 746.4 kt | 1,148.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| riscv64 | 745.4 kt | 1,092.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| s390x | 745.7 kt | 1,112.0 kt | [tiedostoluettelo] |
| sparc64 (epävirallinen siirros) | 741.2 kt | 2,045.0 kt | [tiedostoluettelo] |