[ Källkod: r-bioc-pwalign ]
Paket: r-bioc-pwalign (1.2.0-3)
Länkar för r-bioc-pwalign
Debianresurser:
Hämta källkodspaketet r-bioc-pwalign:
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.dsc]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0.orig.tar.xz]
- [r-bioc-pwalign_1.2.0-3.debian.tar.xz]
Ansvariga:
Externa resurser:
- Hemsida [bioconductor.org]
Liknande paket:
Perform pairwise sequence alignments
The two main functions in the package are pairwiseAlignment() and stringDist(). The former solves (Needleman-Wunsch) global alignment, (Smith-Waterman) local alignment, and (ends-free) overlap alignment problems. The latter computes the Levenshtein edit distance or pairwise alignment score matrix for a set of strings.
Andra paket besläktade med r-bioc-pwalign
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.1.3) [alpha]
- GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6.1-udeb
-
- dep: r-api-4.0
- virtuellt paket som tillhandahålls av r-base-core
-
- dep: r-api-bioc-3.20
- virtuellt paket som tillhandahålls av r-bioc-biocgenerics
-
- dep: r-bioc-biocgenerics
- generic functions for Bioconductor
-
- dep: r-bioc-biostrings (>= 2.71.5)
- GNU R string objects representing biological sequences
-
- dep: r-bioc-iranges
- GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges
-
- dep: r-bioc-s4vectors
- BioConductor S4 implementation of vectors and lists
-
- dep: r-bioc-xvector
- BioConductor representation and manpulation of external sequences
-
- sug: r-cran-runit
- GNU R package providing unit testing framework
Hämta r-bioc-pwalign
| Arkitektur | Paketstorlek | Installerad storlek | Filer |
|---|---|---|---|
| alpha (inofficiell anpassning) | 745,3 kbyte | 1.148,0 kbyte | [filförteckning] |
| amd64 | 746,0 kbyte | 1.108,0 kbyte | [filförteckning] |
| arm64 | 744,6 kbyte | 1.148,0 kbyte | [filförteckning] |
| loong64 (inofficiell anpassning) | 744,7 kbyte | 1.147,0 kbyte | [filförteckning] |
| mips64el | 743,0 kbyte | 1.156,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64 (inofficiell anpassning) | 748,3 kbyte | 1.213,0 kbyte | [filförteckning] |
| ppc64el | 746,4 kbyte | 1.148,0 kbyte | [filförteckning] |
| riscv64 | 745,4 kbyte | 1.092,0 kbyte | [filförteckning] |
| s390x | 745,7 kbyte | 1.112,0 kbyte | [filförteckning] |
| sparc64 (inofficiell anpassning) | 741,2 kbyte | 2.045,0 kbyte | [filförteckning] |