Balík: r-bioc-shortread (1.60.0-2 a iné)

Odkazy pre r-bioc-shortread

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík r-bioc-shortread:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [bioconductor.org]

Podobné balíky:

GNU R classes and methods for high-throughput short-read sequencing data

This BioConductor module is a package for input, quality assessment, manipulation and output of high-throughput sequencing data. ShortRead is provided in the R and Bioconductor environments, allowing ready access to additional facilities for advanced statistical analysis, data transformation, visualization and integration with diverse genomic resources.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-shortread

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.7) [hppa, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.7) [alpha]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie hppa, ia64, m68k, sparc64]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

podporná knižnica GCC
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]

Balík nie je dostupný
dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [m68k, sparc64]

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: libstdc++6 (>= 11) [nie m68k, sparc64]

štandardná knižnica C++ GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 5.2) [m68k, sparc64]
dep: libunwind8 [ia64]

nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
dep: r-api-3.4 [m68k]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-3.5 [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-4.0 [nie m68k, sparc64]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-bioc-3.18 [nie m68k, sparc64, x32]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics
dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]

jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
dep: r-bioc-biobase

base functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.23.3)

generic functions for Bioconductor
dep: r-bioc-biocparallel

BioConductor facilities for parallel evaluation
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.37.1) [m68k]

GNU R string objects representing biological sequences

dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [nie m68k]
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.1.19) [m68k]

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2) [nie m68k]
dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6) [nie m68k]

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.5.4) [m68k]
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.6) [m68k]

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [nie m68k]
dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.12) [nie m68k]

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

dep: r-bioc-iranges (>= 2.3.7) [m68k]
dep: r-bioc-rhtslib [nie m68k, sparc64]

HTSlib high-throughput sequencing library as GNU R package
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.21.4) [m68k]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2) [nie m68k]
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.8) [m68k]

BioConductor S4 implementation of vectors and lists

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.17.25) [nie m68k]
dep: r-bioc-xvector [nie m68k, sparc64]

BioConductor representation and manpulation of external sequences
dep: r-bioc-zlibbioc [nie m68k, sparc64]

(Virtual) zlibbioc Bioconductor package
dep: r-cran-hwriter

HTML Writer - Outputs R objects in HTML format
dep: r-cran-lattice

balík GNU R pre grafiku „Trellis“
dep: r-cran-latticeextra

balík GNU R s ďalšími grafickými zobrazeniami založenými na mriežke
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

rec: r-cran-runit

GNU R package providing unit testing framework

sug: r-bioc-biocstyle [nie m68k, sparc64]

standard styles for vignettes and other Bioconductor documents
sug: r-bioc-biomart

GNU R Interface to BioMart databases (Ensembl, COSMIC, Wormbase and Gramene)
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-cran-runit [nie sparc64]

GNU R package providing unit testing framework

Stiahnuť r-bioc-shortread

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.60.0-2	5,065.2 kB	7,559.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.60.0-2	5,068.8 kB	7,507.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.60.0-2	5,063.6 kB	7,557.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.60.0-2	5,064.8 kB	7,527.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.60.0-2	5,072.7 kB	7,620.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.36.0-1	4,189.1 kB	6,069.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.60.0-2	5,058.1 kB	7,571.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.60.0-2	5,070.7 kB	7,626.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.60.0-2	5,069.7 kB	7,621.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.60.0-2	5,066.5 kB	7,491.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.60.0-2	5,067.5 kB	7,521.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.60.0-2	5,066.6 kB	7,494.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.40.0-1	4,896.8 kB	7,343.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.56.1-1	5,043.0 kB	7,479.0 kB	[zoznam súborov]