Paquet : r-bioc-rtracklayer (1.66.0-3 et autres)

Liens pour r-bioc-rtracklayer

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Ressources externes :

Page d'accueil [bioconductor.org]

Paquets similaires :

GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

Extensible framework for interacting with multiple genome browsers (currently UCSC built-in) and manipulating annotation tracks in various formats (currently GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig and 2bit built-in). The user may export/import tracks to/from the supported browsers, as well as query and modify the browser state, such as the current viewport.

Autres paquets associés à r-bioc-rtracklayer

dépendances

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enhances

dep: libc6 (>= 2.15) [m68k]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.28) [sparc64]

dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [non hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec OpenSSL
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0) [m68k]

Paquet indisponible
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [non hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

trousse à outils SSL - bibliothèques partagées
dep: r-api-3.4 [m68k]

Paquet indisponible
dep: r-api-3.5 [sparc64]

Paquet indisponible
dep: r-api-4.0 [non m68k, sparc64]

paquet virtuel fourni par r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Paquet indisponible
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

Paquet indisponible
dep: r-api-bioc-3.20 [non hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

paquet virtuel fourni par r-bioc-biocgenerics
dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

Paquet indisponible
dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]

noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.8) [m68k]

generic functions for Bioconductor

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1) [sparc64]

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.35.3) [non m68k, sparc64]
dep: r-bioc-biocio [non m68k, sparc64]

standard input and output for Bioconductor packages
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.43.7) [m68k]

GNU R string objects representing biological sequences

dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [non m68k]
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2) [non m68k]

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.3.14) [m68k]
dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6) [non m68k]

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.5.4) [m68k]
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.20) [m68k]

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [sparc64]

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.37.2) [non m68k, sparc64]
dep: r-bioc-iranges (>= 2.11.12) [m68k]

conteneurs de bas niveau de GNU R de stockage de plages d’entiers

dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.13) [non m68k]
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.8) [m68k]

importation de fichiers BAM, BCF et tabix pour GNU R

dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2) [non m68k]
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13) [m68k]

BioConductor S4 implementation of vectors and lists

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.19.22) [sparc64]

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18) [non m68k, sparc64]
dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7) [non m68k]

BioConductor representation and manpulation of external sequences

dep: r-bioc-xvector (>= 0.9.4) [m68k]
dep: r-bioc-zlibbioc [non m68k]

(Virtual) zlibbioc Bioconductor package
dep: r-cran-curl [non hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

GNU R modern and flexible web client for R
dep: r-cran-httr [non hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

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dep: r-cran-rcurl (>= 1.4-2) [hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

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dep: r-cran-restfulr (>= 0.0.13) [non m68k, sparc64]

interface de GNU R pour des services web RESTful
dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

paquet de GNU R pour la génération et analyse d’XML
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Bibliothèque de compression - binaires

sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

infrastructure de BioConductor pour les paquets de données de génome basés sur Biostrings
sug: r-bioc-genefilter

méthodes de filtrage de gènes à partir d’expériences sur puce
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-bioc-limma

modèles linéaires pour des données de biopuce (microarray)
sug: r-bioc-org.hs.eg.db [non m68k, sparc64]

genome-wide annotation for Human
sug: r-cran-runit

paquet de GNU R fournissant un cadriciel de tests unitaires

Télécharger r-bioc-rtracklayer

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.66.0-3	5 096,7 ko	6 773,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.66.0-3	5 096,8 ko	6 668,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.66.0-3	5 087,1 ko	6 708,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.62.0-1	4 970,1 ko	6 722,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.62.0-1	5 004,6 ko	7 092,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.66.0-3	5 091,9 ko	6 708,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.38.0-1	1 824,3 ko	2 765,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.66.0-3	5 084,1 ko	6 738,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.66.0-3	5 111,1 ko	6 911,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.66.0-3	5 109,7 ko	6 836,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.66.0-3	5 095,0 ko	6 620,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.66.0-3	5 095,9 ko	6 700,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.62.0-1	4 982,8 ko	6 647,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.42.1-2	2 356,6 ko	3 783,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.58.0-1	4 983,9 ko	6 659,0 ko	[liste des fichiers]