Balík: r-bioc-rtracklayer (1.66.0-3 a iné)

Odkazy pre r-bioc-rtracklayer

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík r-bioc-rtracklayer:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [bioconductor.org]

Podobné balíky:

GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

Extensible framework for interacting with multiple genome browsers (currently UCSC built-in) and manipulating annotation tracks in various formats (currently GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig and 2bit built-in). The user may export/import tracks to/from the supported browsers, as well as query and modify the browser state, such as the current viewport.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom r-bioc-rtracklayer

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.15) [m68k]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.28) [sparc64]

dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

jednoducho použiteľná klientská knižnica na prenos URL (OpenSSL)
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0) [m68k]

Balík nie je dostupný
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [nie hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

sada nástrojov SSL (Secure Sockets Layer) - zdieľné knižnice
dep: r-api-3.4 [m68k]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-3.5 [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-4.0 [nie m68k, sparc64]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

Balík nie je dostupný
dep: r-api-bioc-3.20 [nie hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

virtuálny balík poskytovaný balíkom r-bioc-biocgenerics
dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

Balík nie je dostupný
dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]

jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.8) [m68k]

generic functions for Bioconductor

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1) [sparc64]

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.35.3) [nie m68k, sparc64]
dep: r-bioc-biocio [nie m68k, sparc64]

standard input and output for Bioconductor packages
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.43.7) [m68k]

GNU R string objects representing biological sequences

dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [nie m68k]
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2) [nie m68k]

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.3.14) [m68k]
dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6) [nie m68k]

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.5.4) [m68k]
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.20) [m68k]

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [sparc64]

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.37.2) [nie m68k, sparc64]
dep: r-bioc-iranges (>= 2.11.12) [m68k]

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.13) [nie m68k]
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.8) [m68k]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2) [nie m68k]
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13) [m68k]

BioConductor S4 implementation of vectors and lists

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.19.22) [sparc64]

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18) [nie m68k, sparc64]
dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7) [nie m68k]

BioConductor representation and manpulation of external sequences

dep: r-bioc-xvector (>= 0.9.4) [m68k]
dep: r-bioc-zlibbioc [nie m68k]

(Virtual) zlibbioc Bioconductor package
dep: r-cran-curl [nie hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

GNU R modern and flexible web client for R
dep: r-cran-httr [nie hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

GNU R tools for working with URLs and HTTP
dep: r-cran-rcurl (>= 1.4-2) [hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
dep: r-cran-restfulr (>= 0.0.13) [nie m68k, sparc64]

GNU R interface to RESTful web wervices
dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

GNU R package for XML parsing and generation
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
sug: r-bioc-genefilter

methods for filtering genes from microarray experiments
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-bioc-limma

linear models for microarray data
sug: r-bioc-org.hs.eg.db [nie m68k, sparc64]

genome-wide annotation for Human
sug: r-cran-runit

GNU R package providing unit testing framework

Stiahnuť r-bioc-rtracklayer

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.66.0-3	5,096.7 kB	6,773.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.66.0-3	5,096.8 kB	6,668.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.66.0-3	5,087.1 kB	6,708.0 kB	[zoznam súborov]
hppa (neoficiálny port)	1.62.0-1	4,970.1 kB	6,722.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.62.0-1	5,004.6 kB	7,092.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	1.66.0-3	5,091.9 kB	6,708.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.38.0-1	1,824.3 kB	2,765.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.66.0-3	5,084.1 kB	6,738.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.66.0-3	5,111.1 kB	6,911.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.66.0-3	5,109.7 kB	6,836.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.66.0-3	5,095.0 kB	6,620.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1.66.0-3	5,095.9 kB	6,700.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.62.0-1	4,982.8 kB	6,647.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.42.1-2	2,356.6 kB	3,783.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.58.0-1	4,983.9 kB	6,659.0 kB	[zoznam súborov]