Paket: r-bioc-rtracklayer (1.66.0-3 und andere)

Links für r-bioc-rtracklayer

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Quellcode-Paket r-bioc-rtracklayer herunterladen:

Betreuer:

Externe Ressourcen:

Homepage [bioconductor.org]

GNU R interface to genome browsers and their annotation tracks

Extensible framework for interacting with multiple genome browsers (currently UCSC built-in) and manipulating annotation tracks in various formats (currently GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig and 2bit built-in). The user may export/import tracks to/from the supported browsers, as well as query and modify the browser state, such as the current viewport.

Andere Pakete mit Bezug zu r-bioc-rtracklayer

hängt ab von

empfiehlt

schlägt vor

erweitert

dep: libc6 (>= 2.15) [m68k]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.28) [sparc64]

dep: libc6 (>= 2.34) [hppa, x32]

dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x]

dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libcurl4t64 (>= 7.16.2) [nicht hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

Einfach nutzbare Client-Bibliothek für URL-Übertragungen (OpenSSL-Variante)
dep: libssl1.1 (>= 1.1.0) [m68k]

Paket nicht verfügbar
dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [nicht hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

Werkzeugsatz für das Secure Socket Layer (SSL) - Laufzeitbibliotheken
dep: r-api-3.4 [m68k]

Paket nicht verfügbar
dep: r-api-3.5 [sparc64]

Paket nicht verfügbar
dep: r-api-4.0 [nicht m68k, sparc64]

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-base-core
dep: r-api-bioc-3.16 [x32]

Paket nicht verfügbar
dep: r-api-bioc-3.18 [hppa, ia64, sh4]

Paket nicht verfügbar
dep: r-api-bioc-3.20 [nicht hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

virtuelles Paket, bereitgestellt durch r-bioc-biocgenerics
dep: r-api-bioc-3.8 [sparc64]

Paket nicht verfügbar
dep: r-base-core (>= 3.4.3-1) [m68k]

GNU R - System für statistische Berechnungen und Grafik - Kern

dep: r-base-core (>= 3.5.2-1) [sparc64]

dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1) [x32]
dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.13.8) [m68k]

generic functions for Bioconductor

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.25.1) [sparc64]

dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.35.3) [nicht m68k, sparc64]
dep: r-bioc-biocio [nicht m68k, sparc64]

standard input and output for Bioconductor packages
dep: r-bioc-biostrings (>= 2.43.7) [m68k]

GNU R string objects representing biological sequences

dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6) [nicht m68k]
dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.15.2) [nicht m68k]

BioConductor utilities for manipulating chromosome identifiers

dep: r-bioc-genomeinfodb (>= 1.3.14) [m68k]
dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.15.6) [nicht m68k]

BioConductor representation and manipulation of short genomic alignments

dep: r-bioc-genomicalignments (>= 1.5.4) [m68k]
dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.21.20) [m68k]

BioConductor representation and manipulation of genomic intervals

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.31.8) [sparc64]

dep: r-bioc-genomicranges (>= 1.37.2) [nicht m68k, sparc64]
dep: r-bioc-iranges (>= 2.11.12) [m68k]

GNU R low-level containers for storing sets of integer ranges

dep: r-bioc-iranges (>= 2.13.13) [nicht m68k]
dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.17.8) [m68k]

GNU R binary alignment (BAM), variant call (BCF), or tabix file import

dep: r-bioc-rsamtools (>= 1.31.2) [nicht m68k]
dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.13.13) [m68k]

BioConductor S4 implementation of vectors and lists

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.19.22) [sparc64]

dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18) [nicht m68k, sparc64]
dep: r-bioc-xvector (>= 0.19.7) [nicht m68k]

BioConductor representation and manpulation of external sequences

dep: r-bioc-xvector (>= 0.9.4) [m68k]
dep: r-bioc-zlibbioc [nicht m68k]

(Virtual) zlibbioc Bioconductor package
dep: r-cran-curl [nicht hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

Moderner und flexibler Web-Client für GNU R
dep: r-cran-httr [nicht hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

GNU R tools for working with URLs and HTTP
dep: r-cran-rcurl (>= 1.4-2) [hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32]

GNU R General network (HTTP/FTP/...) client interface
dep: r-cran-restfulr (>= 0.0.13) [nicht m68k, sparc64]

GNU R interface to RESTful web wervices
dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

GNU R package for XML parsing and generation
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressions-Bibliothek - Laufzeit

sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

BioConductor infrastructure for Biostrings-based genome data packages
sug: r-bioc-genefilter

methods for filtering genes from microarray experiments
sug: r-bioc-genomicfeatures

GNU R tools for making and manipulating transcript centric annotations
sug: r-bioc-limma

linear models for microarray data
sug: r-bioc-org.hs.eg.db [nicht m68k, sparc64]

genome-wide annotation for Human
sug: r-cran-runit

GNU-R-Paket, das ein Programmiergerüst für Komponententests bereitstellt

r-bioc-rtracklayer herunterladen

Download für alle verfügbaren Architekturen
Architektur	Version	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
alpha (inoffizielle Portierung)	1.66.0-3	5.096,7 kB	6.773,0 kB	[Liste der Dateien]
amd64	1.66.0-3	5.096,8 kB	6.668,0 kB	[Liste der Dateien]
arm64	1.66.0-3	5.087,1 kB	6.708,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	1.62.0-1	4.970,1 kB	6.722,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	1.62.0-1	5.004,6 kB	7.092,0 kB	[Liste der Dateien]
loong64 (inoffizielle Portierung)	1.66.0-3	5.091,9 kB	6.708,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	1.38.0-1	1.824,3 kB	2.765,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	1.66.0-3	5.084,1 kB	6.738,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	1.66.0-3	5.111,1 kB	6.911,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	1.66.0-3	5.109,7 kB	6.836,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	1.66.0-3	5.095,0 kB	6.620,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	1.66.0-3	5.095,9 kB	6.700,0 kB	[Liste der Dateien]
sh4 (inoffizielle Portierung)	1.62.0-1	4.982,8 kB	6.647,0 kB	[Liste der Dateien]
sparc64 (inoffizielle Portierung)	1.42.1-2	2.356,6 kB	3.783,0 kB	[Liste der Dateien]
x32 (inoffizielle Portierung)	1.58.0-1	4.983,9 kB	6.659,0 kB	[Liste der Dateien]