[ Paquet source : libvcflib ]
Paquet : libvcflib-tools (1.0.12+dfsg-1 et autres)
Liens pour libvcflib-tools
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source libvcflib :
- [libvcflib_1.0.12+dfsg-1.dsc]
- [libvcflib_1.0.12+dfsg.orig.tar.xz]
- [libvcflib_1.0.12+dfsg-1.debian.tar.xz]
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.
vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:
* an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can be described by the VCF format, * and a collection of command-line utilities for executing complex manipulations on VCF files.
This package contains several tools using the library.
Autres paquets associés à libvcflib-tools
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- dep: libbz2-1.0 [sparc64]
- Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)
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- dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, ppc64, sparc64, x32]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
-
- dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)
- library for entropy measurement of byte streams
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- dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
- library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)
- dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [non amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [non ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
-
- dep: libhts3 (>= 1.10) [sparc64]
- C library for high-throughput sequencing data formats
-
- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]
- librairie de compression au format XZ
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- dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)
- determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
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- dep: libssw0 (>= 1.1) [sparc64]
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- dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
-
- dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- C++ wrapper to tabix indexer
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- dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0) [non ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- C++ wrapper to tabix indexer
-
- dep: libunwind8 [ia64]
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
-
- dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
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- dep: libvcflib2 (>= 1.0.12+dfsg) [non ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- C++ library for parsing and manipulating VCF files
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: r-base-core
- noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques
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- dep: r-cran-ggplot2
- implementation of the Grammar of Graphics
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- dep: r-cran-gridbase
- GNU R Integration of base and grid graphics
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- dep: r-cran-plyr
- tools for splitting, applying and combining data
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]
- Bibliothèque de compression - binaires
-
- sug: r-cran-pracma
- practical numerical math functions for GNU R
Télécharger libvcflib-tools
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| alpha (portage non officiel) | 1.0.12+dfsg-1 | 567,7 ko | 6 144,0 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 1.0.12+dfsg-1 | 593,9 ko | 3 475,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 1.0.12+dfsg-1 | 535,1 ko | 5 999,0 ko | [liste des fichiers] |
| ia64 (portage non officiel) | 1.0.3+dfsg-2 | 853,2 ko | 8 189,0 ko | [liste des fichiers] |
| loong64 (portage non officiel) | 1.0.12+dfsg-1 | 550,1 ko | 5 999,0 ko | [liste des fichiers] |
| m68k (portage non officiel) | 1.0.3+dfsg-2 | 711,2 ko | 4 531,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 1.0.12+dfsg-1 | 562,4 ko | 6 184,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64 (portage non officiel) | 1.0.3+dfsg-2 | 707,1 ko | 8 228,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 1.0.12+dfsg-1 | 582,8 ko | 6 127,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 1.0.12+dfsg-1 | 565,0 ko | 2 615,0 ko | [liste des fichiers] |
| sh4 (portage non officiel) | 1.0.3+dfsg-2 | 808,7 ko | 6 691,0 ko | [liste des fichiers] |
| sparc64 (portage non officiel) | 1.0.3+dfsg-2 | 816,8 ko | 91 827,0 ko | [liste des fichiers] |
| x32 (portage non officiel) | 1.0.3+dfsg-2 | 729,6 ko | 4 483,0 ko | [liste des fichiers] |