Balík: libvcflib-tools (1.0.12+dfsg-1 a iné)

Odkazy pre libvcflib-tools

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík libvcflib:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)

The Variant Call Format (VCF) is a flat-file, tab-delimited textual format intended to concisely describe reference-indexed variations between individuals. VCF provides a common interchange format for the description of variation in individuals and populations of samples, and has become the defacto standard reporting format for a wide array of genomic variant detectors.

vcflib provides methods to manipulate and interpret sequence variation as it can be described by VCF. It is both:

 * an API for parsing and operating on records of genomic variation as it can
   be described by the VCF format,
 * and a collection of command-line utilities for executing complex
   manipulations on VCF files.

This package contains several tools using the library.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom libvcflib-tools

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libbz2-1.0 [sparc64]

kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica
dep: libc6 (>= 2.34) [m68k, ppc64, sparc64, x32]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.35) [sh4]

dep: libc6 (>= 2.38) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64]
dep: libc6.1 (>= 2.35) [ia64]

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libdisorder0 (>= 0.0.2)

library for entropy measurement of byte streams
dep: libfastahack0 (>= 0.0+git20160702.bbc645f) [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (>= 1.0.0+dfsg) [nie amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, sparc64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [nie ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [sh4, sparc64]

dep: libgcc-s1 (>= 3.4.4) [ppc64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

podporná knižnica GCC
dep: libgomp1 (>= 4.2.1) [sparc64]

podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)
dep: libhts3 (>= 1.10) [sparc64]

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

komprimačná knižnica formátu XZ
dep: libsmithwaterman0 (>= 0.0+git20160702.2610e25)

determine similar regions between two strings or genomic sequences (lib)
dep: libssw0 (>= 1.1) [sparc64]

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
dep: libstdc++6 (>= 11) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

štandardná knižnica C++ GNU v3

dep: libstdc++6 (>= 13.1) [nie ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]
dep: libtabixpp0 (>= 1.0.0) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libtabixpp0t64 (>= 1.0.0) [nie ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

C++ wrapper to tabix indexer
dep: libunwind8 [ia64]

nnižnica na určenie na určenie postupnosti volania programu - dynamické súbory
dep: libvcflib1 (>= 1.0.3+dfsg) [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: libvcflib2 (>= 1.0.12+dfsg) [nie ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

C++ library for parsing and manipulating VCF files
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: r-base-core

jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém
dep: r-cran-ggplot2

implementácia Gramatiky grafiky
dep: r-cran-gridbase

GNU R Integration of base and grid graphics
dep: r-cran-plyr

nástroje na rozdeľovanie, aplikovanie a kombinovanie dát
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

komprimačná knižnica - dynamická verzia

sug: r-cran-pracma

practical numerical math functions for GNU R

Stiahnuť libvcflib-tools

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Verzia	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
alpha (neoficiálny port)	1.0.12+dfsg-1	567.7 kB	6,144.0 kB	[zoznam súborov]
amd64	1.0.12+dfsg-1	593.9 kB	3,475.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1.0.12+dfsg-1	535.1 kB	5,999.0 kB	[zoznam súborov]
ia64 (neoficiálny port)	1.0.3+dfsg-2	853.2 kB	8,189.0 kB	[zoznam súborov]
loong64 (neoficiálny port)	1.0.12+dfsg-1	550.1 kB	5,999.0 kB	[zoznam súborov]
m68k (neoficiálny port)	1.0.3+dfsg-2	711.2 kB	4,531.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1.0.12+dfsg-1	562.4 kB	6,184.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64 (neoficiálny port)	1.0.3+dfsg-2	707.1 kB	8,228.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1.0.12+dfsg-1	582.8 kB	6,127.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	1.0.12+dfsg-1	565.0 kB	2,615.0 kB	[zoznam súborov]
sh4 (neoficiálny port)	1.0.3+dfsg-2	808.7 kB	6,691.0 kB	[zoznam súborov]
sparc64 (neoficiálny port)	1.0.3+dfsg-2	816.8 kB	91,827.0 kB	[zoznam súborov]
x32 (neoficiálny port)	1.0.3+dfsg-2	729.6 kB	4,483.0 kB	[zoznam súborov]