[ Paquet source : libssw ]
Paquet : libssw0 (1.1-15 et autres)
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Responsables :
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Ressources externes :
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Paquets similaires :
fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.
Autres paquets associés à libssw0
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
- dep: libc6 (>= 2.40) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.41) [loong64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [non armel, armhf, ia64, m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
-
- dep: zlib1g
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger libssw0
| Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
|---|---|---|---|---|
| alpha (portage non officiel) | 1.1-15+b2 | 25,1 ko | 85,0 ko | [liste des fichiers] |
| amd64 | 1.1-15+b2 | 21,3 ko | 64,0 ko | [liste des fichiers] |
| arm64 | 1.1-15+b2 | 19,6 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| armel | 1.1-15+b2 | 20,9 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| armhf | 1.1-15+b2 | 21,2 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| i386 | 1.1-15+b2 | 26,1 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| ia64 (portage non officiel) | 1.1-14 | 28,7 ko | 89,0 ko | [liste des fichiers] |
| loong64 (portage non officiel) | 1.1-15+b2 | 20,5 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| m68k (portage non officiel) | 1.1-15+b2 | 23,0 ko | 68,0 ko | [liste des fichiers] |
| mips64el | 1.1-15+b2 | 25,5 ko | 86,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64 (portage non officiel) | 1.1-15+b2 | 25,2 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| ppc64el | 1.1-15+b2 | 22,3 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| riscv64 | 1.1-15+b2 | 25,3 ko | 60,0 ko | [liste des fichiers] |
| s390x | 1.1-15+b2 | 25,5 ko | 68,0 ko | [liste des fichiers] |
| sh4 (portage non officiel) | 1.1-15+b2 | 27,9 ko | 84,0 ko | [liste des fichiers] |
| sparc64 (portage non officiel) | 1.1-15+b2 | 23,8 ko | 1 046,0 ko | [liste des fichiers] |
| x32 (portage non officiel) | 1.1-15+b2 | 21,2 ko | 60,0 ko | [liste des fichiers] |