Пакет: murasaki-mpi (1.68.6-13 и други)

Връзки за murasaki-mpi

Ресурси за Debian:

Изтегляне на пакет-източник murasaki.

Отговорници:

Външни препратки:

Начална страница [murasaki.dna.bio.keio.ac.jp]

Подобни пакети:

homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)

Murasaki is a scalable and fast, language theory-based homology detection tool across multiple large genomes. It enable whole-genome scale multiple genome global alignments. Supports unlimited length gapped-seed patterns and unique TF-IDF based filtering.

Murasaki is an anchor alignment software, which is

 * exteremely fast (17 CPU hours for whole Human x Mouse genome (with
   40 nodes: 52 wall minutes))
 * scalable (Arbitrarily parallelizable across multiple nodes using MPI.
   Even a single node with 16GB of ram can handle over 1Gbp of sequence.)
 * unlimited pattern length
 * repeat tolerant
 * intelligent noise reduction

This package provides the MPI-enabled binary for murasaki. While this will speed up operation on multi-processor machines it will slow down on a single processor.

Други пакети, свързани с murasaki-mpi

зависимости

препоръчани

предложени

enhances

dep: libboost-filesystem1.74.0 (>= 1.74.0)

filesystem operations (portable paths, iteration over directories, etc) in C++
dep: libboost-iostreams1.74.0 (>= 1.74.0)

Boost.Iostreams Library
dep: libboost-regex1.74.0-icu72

виртуален пакет, предлаган от libboost-regex1.74.0
dep: libc6 (>= 2.34)

GNU C Library: Shared libraries
също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf, i386, mipsel]

GCC support library

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]
dep: libopenmpi3 (>= 4.1.4)

high performance message passing library -- shared library
dep: libstdc++6 (>= 11)

GNU Standard C++ Library v3
dep: murasaki-common

homology detection tool across multiple large genomes (common files)

Изтегляне на murasaki-mpi

Изтегляне за всички налични архитектури
Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.68.6-13+b3	626,1 кБ	4 010,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.68.6-13+b3	548,8 кБ	4 114,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.68.6-13+b3	409,5 кБ	2 948,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.68.6-13+b3	418,0 кБ	2 116,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.68.6-13+b3	636,0 кБ	3 740,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.68.6-13+b3	592,0 кБ	5 394,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	1.68.6-13+b3	580,4 кБ	4 750,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.68.6-13+b2	626,2 кБ	5 202,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.68.6-13+b2	557,7 кБ	4 266,0 кБ	[списък на файловете]