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套件:gsort(0.1.4-3 以及其他的)

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下載原始碼套件 gsort

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sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

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下載 gsort

下載可用於所有硬體架構的
硬體架構 版本 套件大小 安裝後大小 檔案
amd64 0.1.4-3+b6 1,705。1 kB5,379。0 kB [檔案列表]
arm64 0.1.4-3+b6 1,454。0 kB4,966。0 kB [檔案列表]
armel 0.1.4-3+b6 1,485。7 kB4,613。0 kB [檔案列表]
armhf 0.1.4-3+b6 1,480。4 kB4,613。0 kB [檔案列表]
i386 0.1.4-3+b6 1,620。6 kB4,579。0 kB [檔案列表]
mips64el 0.1.4-3+b6 1,375。7 kB5,457。0 kB [檔案列表]
mipsel 0.1.4-3+b6 1,400。7 kB5,105。0 kB [檔案列表]
ppc64el 0.1.4-3+b6 1,429。0 kB5,030。0 kB [檔案列表]
s390x 0.1.4-3+b6 1,559。0 kB5,289。0 kB [檔案列表]