všetky možnosti
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Zdroj: gsort  ]

Balík: gsort (0.1.4-3 a iné)

Odkazy pre gsort

Screenshot

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík gsort:

Správcovia:

Externé zdroje:

Podobné balíky:

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom gsort

  • závisí
  • odporúča
  • navrhuje
  • vylepšuje

Stiahnuť gsort

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra Verzia Veľkosť balíka Nainštalovaná veľkosť Súbory
amd64 0.1.4-3+b6 1,705.1 kB5,379.0 kB [zoznam súborov]
arm64 0.1.4-3+b6 1,454.0 kB4,966.0 kB [zoznam súborov]
armel 0.1.4-3+b6 1,485.7 kB4,613.0 kB [zoznam súborov]
armhf 0.1.4-3+b6 1,480.4 kB4,613.0 kB [zoznam súborov]
i386 0.1.4-3+b6 1,620.6 kB4,579.0 kB [zoznam súborov]
mips64el 0.1.4-3+b6 1,375.7 kB5,457.0 kB [zoznam súborov]
mipsel 0.1.4-3+b6 1,400.7 kB5,105.0 kB [zoznam súborov]
ppc64el 0.1.4-3+b6 1,429.0 kB5,030.0 kB [zoznam súborov]
s390x 0.1.4-3+b6 1,559.0 kB5,289.0 kB [zoznam súborov]