all options
bullseye  ] [  bookworm  ] [  trixie  ] [  sid  ]
[ Source: gsort  ]

Пакунок: gsort (0.1.4-3 and others)

Links for gsort

Screenshot

Debian Resources:

Download Source Package gsort:

Maintainers:

External Resources:

Similar packages:

sort genomic data

gsort is a tool to sort genomic files according to a genomefile. For example, to sort VCF to have order: X, Y, 2, 1, 3, ... and the header needs to be kept at the top.

As a more likely example, if a file nneds to be sorted to match GATK order (1 ... X, Y, MT) which is not possible with any other sorting tool. With gsort one can simply place MT as the last chrom in the ".genome" file.

It will also be useful for getting files ready for use in bedtools.

Інші пакунки пов'язані з gsort

  • depends
  • recommends
  • suggests
  • enhances

Завантажити gsort

Завантаження для всіх доступних архітектур
Архітектура Версія Розмір пакунка Розмір після встановлення Файли
amd64 0.1.4-3+b6 1,705.1 kB5,379.0 kB [список файлів]
arm64 0.1.4-3+b6 1,454.0 kB4,966.0 kB [список файлів]
armel 0.1.4-3+b6 1,485.7 kB4,613.0 kB [список файлів]
armhf 0.1.4-3+b6 1,480.4 kB4,613.0 kB [список файлів]
i386 0.1.4-3+b6 1,620.6 kB4,579.0 kB [список файлів]
mips64el 0.1.4-3+b6 1,375.7 kB5,457.0 kB [список файлів]
mipsel 0.1.4-3+b6 1,400.7 kB5,105.0 kB [список файлів]
ppc64el 0.1.4-3+b6 1,429.0 kB5,030.0 kB [список файлів]
s390x 0.1.4-3+b6 1,559.0 kB5,289.0 kB [список файлів]