Paket: libbifrost0 (1.3.1-1 och andra)

Länkar för libbifrost0

Debianresurser:

Hämta källkodspaketet bifrost:

Ansvariga:

Externa resurser:

Hemsida [github.com]

Liknande paket:

library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Andra paket besläktade med libbifrost0

beror

rekommenderar

föreslår

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ej arm64]

GNU C-bibliotek: Delade bibliotek
också ett virtuellt paket som tillhandahålls av libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ej amd64, riscv64]

GCC stödbibliotek

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ej arm64]

GNU standardbibliotek v3 för C++

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Kompressionsbibliotek - körtidspaket

Hämta libbifrost0

Hämtningar för alla tillgängliga arkitekturer
Arkitektur	Version	Paketstorlek	Installerad storlek	Filer
amd64	1.3.1-1	417,9 kbyte	1.436,0 kbyte	[filförteckning]
arm64	1.3.1-1+b1	384,9 kbyte	1.325,0 kbyte	[filförteckning]
ppc64el	1.3.1-1	435,0 kbyte	1.644,0 kbyte	[filförteckning]
riscv64	1.3.1-1	424,2 kbyte	1.128,0 kbyte	[filförteckning]
s390x	1.3.1-1	430,1 kbyte	1.524,0 kbyte	[filförteckning]