Paketti: libbifrost0 (1.3.1-1 ja muut)

Links for libbifrost0

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti bifrost:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Muut pakettiin libbifrost0 liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34) [ei arm64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.38) [arm64]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [ei amd64, riscv64]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 13.1) [ei arm64]

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3

dep: libstdc++6 (>= 14) [arm64]
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

pakkauskirjaston ajonaikaistiedostot

Imuroi libbifrost0

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
amd64	1.3.1-1	417.9 kt	1,436.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.3.1-1+b1	384.9 kt	1,325.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.3.1-1	435.0 kt	1,644.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.3.1-1	424.2 kt	1,128.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.3.1-1	430.1 kt	1,524.0 kt	[tiedostoluettelo]