[ Источник: srst2 ]
Пакет: srst2 (0.2.0-11 и другие)
Ссылки для srst2
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код srst2:
Сопровождающие:
- Debian Med Packaging Team (Страница КК, Почтовый архив)
- Andreas Tille (Страница КК)
- Étienne Mollier (Страница КК)
Внешние ресурсы:
- Сайт [katholt.github.io]
Подобные пакеты:
Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
This program is designed to take Illumina sequence data, a MLST database and/or a database of gene sequences (e.g. resistance genes, virulence genes, etc) and report the presence of STs and/or reference genes.
Другие пакеты, относящиеся к srst2
|
|
|
|
-
- dep: bowtie2
- ultrafast memory-efficient short read aligner
-
- dep: cd-hit
- suite of programs designed to quickly group sequences
-
- dep: python [hppa, x32]
- Пакет недоступен
-
- dep: python-biopython [hppa, x32]
- Python library for bioinformatics (implemented in Python 2)
-
- dep: python-scipy [hppa, x32]
- Пакет недоступен
-
- dep: python3 [не hppa, x32]
- интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)
-
- dep: python3-biopython [не hppa, x32]
- Python3 library for bioinformatics
-
- dep: python3-scipy [не hppa, x32]
- scientific tools for Python 3
-
- dep: samtools
- processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
-
- rec: python3-rpy2
- Python3 interface to the GNU R language and environment (version 2)
Загрузка srst2
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| alpha (неофициальный перенос) | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| amd64 | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| arm64 | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| hppa (неофициальный перенос) | 0.1.8-1 | 58,6 Кб | 258,0 Кб | [список файлов] |
| ia64 (неофициальный перенос) | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| m68k (неофициальный перенос) | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| mips64el | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64 (неофициальный перенос) | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| ppc64el | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| riscv64 | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| sh4 (неофициальный перенос) | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| sparc64 (неофициальный перенос) | 0.2.0-11 | 59,6 Кб | 254,0 Кб | [список файлов] |
| x32 (неофициальный перенос) | 0.1.8-1 | 58,6 Кб | 258,0 Кб | [список файлов] |