Пакет: edlib-aligner (1.2.7-6 и другие)

Ссылки для edlib-aligner

Ресурсы Debian:

Исходный код libedlib:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [github.com]

Подобные пакеты:

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Другие пакеты, относящиеся к edlib-aligner

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [не alpha, ia64, loong64, sh4]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

library for sequence alignment using edit distance

dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b3) [не ia64, x32]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [не armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

вспомогательная библиотека GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: libunwind8 [ia64]

библиотека для выявления цепочки вызовов функций в программе

Загрузка edlib-aligner

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	1.2.7-6+b3	22,3 Кб	87,0 Кб	[список файлов]
amd64	1.2.7-6+b3	24,4 Кб	71,0 Кб	[список файлов]
arm64	1.2.7-6+b3	23,0 Кб	87,0 Кб	[список файлов]
armel	1.2.7-6+b3	21,4 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
armhf	1.2.7-6+b3	20,5 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	1.2.7-6+b3	23,0 Кб	55,0 Кб	[список файлов]
i386	1.2.7-6+b3	23,7 Кб	62,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	1.2.7-5	27,5 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
loong64 (неофициальный перенос)	1.2.7-6+b3	23,5 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	1.2.7-6+b3	22,5 Кб	62,0 Кб	[список файлов]
mips64el	1.2.7-6+b3	22,5 Кб	88,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	1.2.7-6+b3	24,1 Кб	87,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	1.2.7-6+b3	26,2 Кб	87,0 Кб	[список файлов]
riscv64	1.2.7-6+b3	21,4 Кб	51,0 Кб	[список файлов]
s390x	1.2.7-6+b3	25,2 Кб	67,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	1.2.7-6+b3	25,0 Кб	86,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	1.2.7-6+b3	20,8 Кб	1 048,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	1.2.7-5+b1	24,3 Кб	66,0 Кб	[список файлов]