Paquet : edlib-aligner (1.2.7-6 et autres)

Liens pour edlib-aligner

Ressources Debian :

Télécharger le paquet source libedlib :

Responsables :

Ressources externes :

Page d'accueil [github.com]

Paquets similaires :

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Autres paquets associés à edlib-aligner

dépendances

recommandations

suggestions

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [non alpha, ia64, loong64, sh4]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

library for sequence alignment using edit distance

dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b3) [non ia64, x32]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

bibliothèque de prise en charge de GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [non armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

bibliothèque de prise en charge de GCC
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

bibliothèque standard C++ de GNU v3
dep: libunwind8 [ia64]

bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

Télécharger edlib-aligner

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	22,3 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.2.7-6+b3	24,4 ko	71,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.2.7-6+b3	23,0 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.2.7-6+b3	21,4 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.2.7-6+b3	20,5 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	23,0 ko	55,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.2.7-6+b3	23,7 ko	62,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.2.7-5	27,5 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
loong64 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	23,5 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	22,5 ko	62,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.2.7-6+b3	22,5 ko	88,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	24,1 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.2.7-6+b3	26,2 ko	87,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.2.7-6+b3	21,4 ko	51,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.2.7-6+b3	25,2 ko	67,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	25,0 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.2.7-6+b3	20,8 ko	1 048,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.2.7-5+b1	24,3 ko	66,0 ko	[liste des fichiers]