Paketti: edlib-aligner (1.2.7-6 ja muut)

Links for edlib-aligner

Debian-palvelut:

Imuroi lähdekoodipaketti libedlib:

Ylläpitäjät:

External Resources:

Kotisivu [github.com]

Samankaltaisia paketteja:

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Muut pakettiin edlib-aligner liittyvät paketit

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.38) [ei alpha, ia64, loong64, sh4]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6-udeb

dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

GNU-C-kirjasto: jaetut kirjastot
myös näennäispaketti, jonka toteuttaa libc6.1-udeb

dep: libc6.1 (>= 2.38) [alpha]
dep: libedlib1 (= 1.2.7-5) [ia64]

library for sequence alignment using edit distance

dep: libedlib1 (= 1.2.7-5+b1) [x32]

dep: libedlib1 (= 1.2.7-6+b3) [ei ia64, x32]
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [x32]

GCC:n apukirjasto

dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [ei armel, armhf, hppa, ia64, m68k, x32]

dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

GCC:n apukirjasto
dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

GCC:n apukirjasto
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

GNU standardi C++ -kirjasto, versio 3
dep: libunwind8 [ia64]

library to determine the call-chain of a program - runtime

Imuroi edlib-aligner

Imurointi kaikille saataville arkkitehtuureille
Arkkitehtuuri	Versio	Paketin koko	Koko asennettuna	Tiedostot
alpha (epävirallinen siirros)	1.2.7-6+b3	22.3 kt	87.0 kt	[tiedostoluettelo]
amd64	1.2.7-6+b3	24.4 kt	71.0 kt	[tiedostoluettelo]
arm64	1.2.7-6+b3	23.0 kt	87.0 kt	[tiedostoluettelo]
armel	1.2.7-6+b3	21.4 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
armhf	1.2.7-6+b3	20.5 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
hppa (epävirallinen siirros)	1.2.7-6+b3	23.0 kt	55.0 kt	[tiedostoluettelo]
i386	1.2.7-6+b3	23.7 kt	62.0 kt	[tiedostoluettelo]
ia64 (epävirallinen siirros)	1.2.7-5	27.5 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
loong64 (epävirallinen siirros)	1.2.7-6+b3	23.5 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
m68k (epävirallinen siirros)	1.2.7-6+b3	22.5 kt	62.0 kt	[tiedostoluettelo]
mips64el	1.2.7-6+b3	22.5 kt	88.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64 (epävirallinen siirros)	1.2.7-6+b3	24.1 kt	87.0 kt	[tiedostoluettelo]
ppc64el	1.2.7-6+b3	26.2 kt	87.0 kt	[tiedostoluettelo]
riscv64	1.2.7-6+b3	21.4 kt	51.0 kt	[tiedostoluettelo]
s390x	1.2.7-6+b3	25.2 kt	67.0 kt	[tiedostoluettelo]
sh4 (epävirallinen siirros)	1.2.7-6+b3	25.0 kt	86.0 kt	[tiedostoluettelo]
sparc64 (epävirallinen siirros)	1.2.7-6+b3	20.8 kt	1,048.0 kt	[tiedostoluettelo]
x32 (epävirallinen siirros)	1.2.7-5+b1	24.3 kt	66.0 kt	[tiedostoluettelo]