Пакет: bali-phy (4.0-1)

Ссылки для bali-phy

Ресурсы Debian:

Исходный код bali-phy:

Сопровождающие:

Внешние ресурсы:

Сайт [www.bali-phy.org]

Подобные пакеты:

Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny

BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.

BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.

Другие пакеты, относящиеся к bali-phy

зависимости

рекомендации

предложения

enhances

dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)

C++ representation of time duration, time point, and clocks
dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0)

C++ containers and algorithms that implement JSON
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

program options library for C++
dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0)

Boost Random Number Library
dep: libc6 (>= 2.38)

библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
dep: libcairo2 (>= 1.4.10)

библиотека для двухмерной векторной графики Cairo
dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1)

fast type-safe C++ formatting library -- library
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

вспомогательная библиотека GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]

dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, riscv64]

dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
dep: libstdc++6 (>= 14)

стандартная библиотека GNU C++ версии 3
dep: perl

практический язык Ларри Уолла для извлечения данных и составления отчётов
dep: python3

интерактивный высокоуровневый объектно-ориентированный язык (версия python3 по умолчанию)

rec: gnuplot

утилита для построения графиков с интерфейсом командной строки
также виртуальный пакет, предоставляемый gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
rec: r-base

система статистических расчетов и построения графиков GNU R

sug: figtree

graphical phylogenetic tree viewer
sug: seaview

Multiplatform interface for sequence alignment and phylogeny

Загрузка bali-phy

Загрузить для всех доступных архитектур
Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	9 822,0 Кб	52 710,0 Кб	[список файлов]
arm64	8 730,3 Кб	47 950,0 Кб	[список файлов]
i386	9 253,0 Кб	51 011,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	9 592,2 Кб	56 065,0 Кб	[список файлов]
riscv64	10 112,1 Кб	41 347,0 Кб	[список файлов]
s390x	7 548,7 Кб	48 143,0 Кб	[список файлов]