[ ソース: bali-phy ]
パッケージ: bali-phy (4.0-1)
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メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [www.bali-phy.org]
類似のパッケージ:
Bayesian Inference of Alignment and Phylogeny
BAli-Phy estimates multiple sequence alignments and evolutionary trees from unaligned DNA, amino acid, or codon sequences. BAli-Phy uses MCMC to estimate evolutionary trees, positive selection, and branch lengths while averaging over alternative alignments. BAli-Phy can display alignment ambiguity graphically in an alignment uncertainty (AU) plot.
BAli-Phy can also estimate phylogenies from a fixed alignment (like MrBayes and BEAST) using substitution models like GTR+gamma. BAli-Phy automatically estimates relative rates for each gene.
その他の bali-phy 関連パッケージ
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- dep: libboost-chrono1.83.0t64 (>= 1.83.0)
- 時間、時刻、クロックの C++ 表現
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- dep: libboost-json1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ containers and algorithms that implement JSON
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- dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)
- C++ 用プログラムオプションライブラリ
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- dep: libboost-random1.83.0 (>= 1.83.0)
- Boost 乱数ライブラリ
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libcairo2 (>= 1.4.10)
- Cairo 二次元ベクトルグラフィックライブラリ
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- dep: libfmt10 (>= 10.1.1+ds1)
- fast type-safe C++ formatting library -- library
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]
- dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, riscv64]
- dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]
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- dep: libstdc++6 (>= 14)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: perl
- Larry Wall 作の実用的な抽出とレポート用の言語
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- dep: python3
- 対話式の高レベルオブジェクト指向言語 (デフォルト python3 バージョン)
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- rec: gnuplot
- Command-line driven interactive plotting program.
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: gnuplot-nox, gnuplot-qt, gnuplot-x11
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- rec: r-base
- GNU R 統計計算・グラフィックスシステム