[ Источник: skewer ]
Пакет: skewer (0.2.2-6 и другие)
Ссылки для skewer
Ресурсы Debian:
- Сообщения об ошибках
- Developer Information
- Debian журнал изменений
- Файл авторских прав
- Отслеживание заплат Debian
Исходный код skewer:
Сопровождающие:
Внешние ресурсы:
- Сайт [github.com]
Подобные пакеты:
post-processing of high-throughput DNA sequence reads
skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.
Features
* Detection and removal of adapter sequences * Insertion and deletion allowed in pattern matching * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads * Demultiplexing of barcoded sequencing runs * Multi-threading support * Trimming based on phred quality scores * IUPAC characters for barcodes and adapters * Compressed input and output support
Другие пакеты, относящиеся к skewer
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- вспомогательная библиотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- стандартная библиотека GNU C++ версии 3
Загрузка skewer
| Архитектура | Версия | Размер пакета | В установленном виде | Файлы |
|---|---|---|---|---|
| i386 | 0.2.2-6+b1 | 90,2 Кб | 231,0 Кб | [список файлов] |