[ Pakiet źródłowy: skewer ]
Pakiet: skewer (0.2.2-6 i inne)
Odnośniki dla skewer
Zasoby systemu Debian:
- Raporty o błędach
- Developer Information
- Dziennik zmian w systemie Debian
- Informacje nt. praw autorskich
- Śledzenie łatek systemu Debian
Pobieranie pakietu źródłowego skewer:
Opiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
post-processing of high-throughput DNA sequence reads
skewer implements the bit-masked k-difference matching algorithm dedicated to the task of adapter trimming and it is specially designed for processing next-generation sequencing (NGS) paired-end sequences.
Features
* Detection and removal of adapter sequences * Insertion and deletion allowed in pattern matching * Targeted at Single End, Paired End (PE), and Long Mate Pair (LMP) reads * Demultiplexing of barcoded sequencing runs * Multi-threading support * Trimming based on phred quality scores * IUPAC characters for barcodes and adapters * Compressed input and output support
Inne pakiety związane z skewer
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.34)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
Pobieranie skewer
| Architektura | Wersja | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|---|
| i386 | 0.2.2-6+b1 | 90,2 KiB | 231,0 KiB | [lista plików] |