Pakiet: bitseq (0.7.5+dfsg-6) [debports]
Odnośniki dla bitseq
Zasoby systemu Debian:
Pobieranie pakietu źródłowego :
Nie znalezionoOpiekunowie:
Zasoby zewnętrzne:
- Strona internetowa [github.com]
Podobne pakiety:
Bayesian Inference of Transcripts from Sequencing Data
BitSeq is an application for inferring expression levels of individual transcripts from sequencing (RNA-Seq) data and estimating differential expression (DE) between conditions. An advantage of this approach is the ability to account for both technical uncertainty and intrinsic biological variance in order to avoid false DE calls. The technical contribution to the uncertainty comes both from finite read-depth and the possibly ambiguous mapping of reads to multiple transcripts.
Inne pakiety związane z bitseq
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.29)
- Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- Biblioteka wspomagająca GCC
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
-
- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
-
- dep: python3
- Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
-
- dep: python3-numpy
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze
-
- sug: samtools
- Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
Pobieranie bitseq
| Architektura | Rozmiar pakietu | Rozmiar po instalacji | Pliki |
|---|---|---|---|
| m68k (port nieoficjalny) | 317,5 KiB | 1 730,0 KiB | [lista plików] |