Paquet : bitseq (0.7.5+dfsg-6) [debports]
Liens pour bitseq
Ressources Debian :
Télécharger le paquet source :
IntrouvableResponsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
inférence bayésienne de transcripts à partir de données de séquençage
BitSeq est une application pour inférer des niveaux d’expression de transcripts individuels depuis des données de séquençage (RNA-Seq) et pour estimer l’expression différentielle (DE) entre des « conditions ». Un avantage de cette approche est la capacité d’expliquer l’incertitude technique et la variance biologique pour éviter de faux appels DE. La contribution technique à l’incertitude vient depuis la profondeur de lecture finie et la correspondance potentiellement ambiguë de lectures depuis plusieurs transcripts.
Autres paquets associés à bitseq
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- dep: libc6 (>= 2.29)
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- bibliothèque de prise en charge de GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- bibliothèque GCC pour OpenMP (GOMP)
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- dep: python3-numpy
- gestion rapide des tableaux pour le langage Python – Python 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)
- Bibliothèque de compression - binaires
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- sug: samtools
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
Télécharger bitseq
| Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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| m68k (portage non officiel) | 317,5 ko | 1 730,0 ko | [liste des fichiers] |