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inferenza bayesiana di trascritti da dati di sequenziamento

BitSeq è un'applicazione per inferire livelli di espressione di trascritti individuali da dati di sequenziamento (RNA-Seq) e stimare l'espressione differenziale (DE) tra condizioni. Un vantaggio di questo approccio è la capacità di tenere conto sia dell'incertezza tecnica, sia dell'intrinseca varianza biologica al fine di evitare false identificazioni DE. Il contributo tecnico all'incertezza viene sia dalla profondità di lettura finita, sia dall'eventuale mappatura ambigua delle letture verso più trascritti.

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