Pakiet: samtools (1.22.1-1)

Odnośniki dla samtools

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego samtools:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [www.htslib.org]

Podobne pakiety:

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM

Samtools to zestaw narzędzi zarządzających dopasowaniami sekwencji nukleotydów w binarnym formacie BAM. Importuje i eksportuje do formatów ascii SAM (Sequence Alignment/Map) i CRAM, sortuje, łączy i indeksuje, a także umożliwia szybkie pobieranie odczytów z dowolnych regionów. Został zaprojektowany do pracy na strumieniu i może otwierać plik BAM lub CRAM (ale nie w formacie SAM) na zdalnym serwerze FTP lub HTTP.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Sieć: Klient, Protokół sieciowy: FTP, protocol::http, role::program, Zakres: Narzędzie, Pakiet narzędziowy interfejsu: Ncurses (terminalowy), Przeznaczenie: use::analysing, use::calculating, Filtrowanie, Działa z: Sekwencje biologiczne

Inne pakiety związane z samtools

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libhts3t64 (>= 1.22.1+ds-1)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libncurses6 (>= 6)

Biblioteki współdzielone przeznaczone do obsługi terminala
dep: libtinfo6 (>= 6)

Współdzielona, niskopoziomowa biblioteka terminfo do obsługi terminala
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armhf, i386]

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf, i386]

sug: cwltool

Common Workflow Language reference implementation

Pobieranie samtools

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	680,3 KiB	1 495,0 KiB	[lista plików]
arm64	650,1 KiB	1 755,0 KiB	[lista plików]
armhf	645,0 KiB	1 556,0 KiB	[lista plików]
i386	713,4 KiB	1 632,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	706,9 KiB	2 011,0 KiB	[lista plików]
riscv64	685,7 KiB	1 339,0 KiB	[lista plików]
s390x	683,6 KiB	1 555,0 KiB	[lista plików]