Pakiet: flye (2.9.6+dfsg-1)

Odnośniki dla flye

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego flye:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [github.com]

Podobne pakiety:

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Inne pakiety związane z flye

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.38)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie riscv64]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 14)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library
dep: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

Pobieranie flye

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	22 656,0 KiB	36 932,0 KiB	[lista plików]
arm64	22 576,1 KiB	36 731,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	22 648,5 KiB	37 115,0 KiB	[lista plików]
riscv64	22 634,8 KiB	36 479,0 KiB	[lista plików]
s390x	22 685,6 KiB	37 087,0 KiB	[lista plików]