Balík: flye (2.9.6+dfsg-1)

Odkazy pre flye

Zdroje Debian:

Stiahnuť zdrojový balík flye:

Správcovia:

Externé zdroje:

Domovská stránka [github.com]

Podobné balíky:

de novo assembler for single molecule sequencing reads using repeat graphs

Flye is a de novo assembler for single molecule sequencing reads, such as those produced by PacBio and Oxford Nanopore Technologies. It is designed for a wide range of datasets, from small bacterial projects to large mammalian-scale assemblies. The package represents a complete pipeline: it takes raw PacBio / ONT reads as input and outputs polished contigs. Flye also has a special mode for metagenome assembly.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom flye

závisí

odporúča

navrhuje

vylepšuje

dep: libc6 (>= 2.38)

knižnica GNU C - zdieľané knižnice
tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie riscv64]

podporná knižnica GCC

dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
dep: libstdc++6 (>= 14)

štandardná knižnica C++ GNU v3
dep: minimap2

versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
dep: python3

interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
dep: python3-six

Python 2 and 3 compatibility library
dep: samtools

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

komprimačná knižnica - dynamická verzia

Stiahnuť flye

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry
Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	22,656.0 kB	36,932.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	22,576.1 kB	36,731.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	22,648.5 kB	37,115.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	22,634.8 kB	36,479.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	22,685.6 kB	37,087.0 kB	[zoznam súborov]