Pakiet: stacks (2.2+dfsg-1)

Odnośniki dla stacks

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego stacks:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [creskolab.uoregon.edu]

Podobne pakiety:

pipeline for building loci from short-read DNA sequences

Stacks is a software pipeline for building loci from short-read sequences, such as those generated on the Illumina platform. Stacks was developed to work with restriction enzyme-based data, such as RAD-seq, for the purpose of building genetic maps and conducting population genomics and phylogeography.

Note that this package installs Stacks such that all commands must be run as: $ stacks <cmdname> <args>

Inne pakiety związane z stacks

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.17)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: libdbi-perl

Interfejs bazodanowy Perl (DBI)
dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [nie armhf]

Biblioteka wspomagająca GCC

dep: libgcc1 (>= 1:3.5) [armhf]
dep: libgomp1 (>= 4.9)

Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)
dep: libhts2 (>= 1.0)

C library for high-throughput sequencing data formats
dep: libstdc++6 (>= 5.2)

Standardowa biblioteka GNU C++, wersja 3
dep: python

Interaktywny, wysokopoziomowy język obiektowy (wersja Python2)
dep: samtools

Przetwarzanie dopasowań sekwencji w formatach SAM, BAM i CRAM
dep: zlib1g (>= 1:1.2.6)

Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

rec: libspreadsheet-writeexcel-perl

module to create Excel spreadsheets

Pobieranie stacks

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	927,4 KiB	4 887,0 KiB	[lista plików]
arm64	814,6 KiB	4 373,0 KiB	[lista plików]
armhf	772,8 KiB	2 869,0 KiB	[lista plików]