Package: fastqtl (2.184+v7+dfsg-4 and others) [debports]

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mappatore Quantitative Trait Loci (QTL) in cis per fenotipi molecolari

L'obiettivo di FastQTL è di identificare polimorfismi a nucleotide singolo (SNP) che sono associati in maniera significativa a vari fenotipi molecolari (cioè espressioni di geni conosciuti, livelli di metilazione della citosina, ecc.). Esegue scansioni per tutte le possibili coppie fenotipo-variante in cis (cioè varianti localizzate all'interno di una finestra specifica intorno a un fenotipo). FastQTL implementa un nuovo schema di permutazione (approssimazione Beta) per correggere accuratamente e velocemente test multipli sia a livello di genotipo sia di fenotipo.

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dep: libblas3

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or libblas.so.3

virtual package provided by libatlas3-base, libblas3, libblis4-openmp, libblis4-pthread, libblis4-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial
dep: libboost-iostreams1.83.0 (>= 1.83.0)

libreria Boost.Iostreams
dep: libboost-program-options1.83.0 (>= 1.83.0)

libreria per opzioni di programma per C++
dep: libbz2-1.0

libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
dep: libc6 (>= 2.38)

Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: libgcc-s1 (>= 3.4)

libreria di supporto a GCC
dep: libgsl28 (>= 2.8+dfsg)

GNU Scientific Library (GSL) -- pacchetto della libreria
dep: libgslcblas0 (>= 2.8)

libreria scientifica GNU (GSL) -- pacchetto di libreria blas
dep: libhts3t64 (>= 1.17)

libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
dep: libstdc++6 (>= 14)

libreria GNU Standard C++, versione 3
dep: python3

linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
dep: r-mathlib (>= 4.4.1)

libreria matematica autonoma di GNU R
dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

libreria di compressione - runtime

rec: r-cran-argparser

analizzatore degli argomenti della riga di comando per GNU R
rec: r-cran-qvalue

Package not available
rec: r-cran-tools

Package not available

sug: fastqtl-doc

mappatore QTL in cis per fenotipi molecolari - documentazione

Download fastqtl

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
sparc64 (unofficial port)	2.184+v7+dfsg-4+b3	177.3 kB	1,116.0 kB	[list of files]