Package: python3-mappy (2.27+dfsg-1 and others)

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Similar packages:

interfaccia Python 3 per minimap2

Minimap2 è un versatile programma per l'allineamento di sequenze che allinea sequenze di DNA o mRNA rispetto a un grande database di riferimento. Casi d'uso tipici includono: (1) mappatura di letture genomiche PacBio o Oxford Nanopore con il genoma umano; (2) ricerca di sovrapposizioni tra letture lunghe con tassi di errore fino a ~15%; (3) allineamento, tenendo conto degli splice, di letture PacBio Iso-Seq o Nanopore cDNA o Direct RNA rispetto a un genoma di riferimento; (4) allineamento di letture Illumina singole o accoppiate; (5) allineamento assemblaggio-verso-assemblaggio; (6) allineamento dell'intero genoma tra due specie strettamente imparentate con divergenza sotto a ~15%.

Questo pacchetto contiene l'interfaccia Python 3 per usare minimap2.

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linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

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dep: python3 (>= 3.12~) [m68k, x32]

dep: python3 (>= 3.13~) [not ia64, m68k, x32]
dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

libreria di compressione - runtime

Download python3-mappy

Download for all available architectures
Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b2	174.3 kB	498.0 kB	[list of files]
amd64	2.27+dfsg-1+b3	145.6 kB	375.0 kB	[list of files]
arm64	2.27+dfsg-1+b4	139.3 kB	367.0 kB	[list of files]
armel	2.27+dfsg-1+b3	153.9 kB	427.0 kB	[list of files]
armhf	2.27+dfsg-1+b3	155.6 kB	363.0 kB	[list of files]
hppa (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b3	184.1 kB	473.0 kB	[list of files]
i386	2.27+dfsg-1+b3	183.1 kB	524.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.24+dfsg-3+b1	256.8 kB	1,500.0 kB	[list of files]
loong64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b3	160.3 kB	431.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b2	167.8 kB	784.0 kB	[list of files]
mips64el	2.27+dfsg-1+b3	167.0 kB	509.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b3	179.8 kB	559.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.27+dfsg-1+b3	169.5 kB	495.0 kB	[list of files]
riscv64	2.27+dfsg-1+b3	180.7 kB	359.0 kB	[list of files]
s390x	2.27+dfsg-1+b3	189.7 kB	499.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b2	206.1 kB	428.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b3	153.9 kB	1,077.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.27+dfsg-1+b1	177.9 kB	738.0 kB	[list of files]