Package: ssake (4.0.1-1)

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Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Andreas Tille (QA Page)
Charles Plessy (QA Page)

External Resources:

Homepage [www.bcgsc.ca]

Similar packages:

applicazione genomica per assemblare milioni di cortissime sequenze di DNA

SSAKE (Short Sequence Assembly by K-mer search and 3′ read Extension, assemblaggio di sequenze corte con ricerca di K-meri ed estensione per lettura 3') è un'applicazione genomica per assemblare in modo aggressivo milioni di corte sequenze di nucleotidi cercando progressivamente k-meri all'estremità 3' perfetti usando un albero di prefissi di DNA. SSAKE è progettato per aiutare a sfruttare le informazioni provenienti dalla lettura di corte sequenze riunendole in maniera stringente in frammenti continui che possono essere usati per caratterizzare innovativi target di sequenziamento.

Tags: Field: Biology, Implemented in: Perl, implemented-in::python, interface::commandline, User Interface: Command Shell, Role: role::program, scope::utility, Purpose: Analysing

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sug: ssake-examples

dati di esempio per SSAKE, un assemblatore genomico di letture corte

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	48.9 kB	214.0 kB	[list of files]