Paquet : ssake (4.0.1-1)

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Paquets similaires :

application de génomique pour assembler des millions de séquences très courtes d’ADN

Short Sequence Assembly par recherche de K-mer et l’extension de troisième lecture (SSAKE) est une application de génomique pour assembler énergiquement des millions de séquences courtes de nucléotides en recherchant progressivement les « 3′-most k-mers » en utilisant un arbre de préfixes d’ADN. SSAKE est conçu pour aider à exploiter les informations de lectures de courtes séquences en les regroupant rigoureusement dans des contigs pouvant être utilisés pour caractériser les cibles de séquençage nouvelles.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Mis en œuvre en: Perl, implemented-in::python, interface::commandline, Interface utilisateur: Interpréteur de commandes, Rôle: role::program, scope::utility, But: Analyse

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sug: ssake-examples

example data for SSAKE, a genomic assembler of short reads

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
all	48,9 ko	214,0 ko	[liste des fichiers]