Package: proteinortho (6.0.31+dfsg-2) [debports]
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Similar packages:
rilevazione di (co-)ortologhi in analisi su vasta scala di proteine
Proteinortho è uno strumento autonomo che è diretto verso grandi insiemi di dati e fa uso di tecniche di calcolo distribuito quando gira su hardware multi-core. Implementa una versione estesa dell'euristica per il miglior allineamento reciproco. Proteinortho è stato applicato per calcolare le proteine ortologhe nell'insieme completo di tutti i 717 genomi eubatterici disponibili su NCBI all'inizio del 2009. Gli autori sono riusciti ad identificare trenta proteine presenti nel 99% di tutti i proteomi batterici.
Other Packages Related to proteinortho
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- dep: diamond-aligner
- allineatore di sequenze locali accelerato compatibile con BLAST
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- dep: libc6 (>= 2.32)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgomp1 (>= 6)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: liblapack3
- libreria di routine per l'algebra lineare 3 - versione condivisa
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: ncbi-blast+
- suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST
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- dep: perl
- "Practical Extraction and Report Language" di Larry Wall
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- dep: procps
- utilità per il filesystem /proc
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- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
Download proteinortho
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| m68k (unofficial port) | 207.1 kB | 771.0 kB | [list of files] |