Package: proteinortho (6.0.31+dfsg-2) [debports]
Links for proteinortho
Debian Resources:
Download Source Package :
Not foundMaintainers:
External Resources:
- Homepage [gitlab.com]
Similar packages:
Registrering af (Co-)ortologer i storskala proteinanalyse
Proteinortho er et uafhængigt værktøj, der er rettet mod store datasæt og gør brug af distribuerede beregningsteknikker, når afviklet på udstyr med flere kerner. Programmet implementerer en udvidet version af den reciprokke bedste sammenligningsheuristik. Proteinortho blev brugt til at beregne orthologous-proteiner i det fulde sæt med alle 717 eubakterielle genomer tilgængelige hos NCBI i begyndelsen af 2009. Forfattere lykkedes med at identificere 30 proteiner til stede i 99 % af alle bakterieproteomer.
Other Packages Related to proteinortho
|
|
|
|
-
- dep: diamond-aligner
- Accelereret BLAST-kompatibel lokal sekvenssammenligner
-
- dep: libc6 (>= 2.32)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1)
- GCC støttebibliotek
-
- dep: libgomp1 (>= 6)
- GCC OpenMP-understøttelsesbibliotek (GOMP)
-
- dep: liblapack3
- Bibliotek for lineære algebrarutiner 3 - delt version
-
- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: ncbi-blast+
- Næste generation programpakke for BLAST-sekvens søgeværktøjer
-
- dep: perl
- Larry Walls praktiske uddragnings- og rapportsprog (Perl)
-
- dep: procps
- /proc-filsystemværktøjer
-
- dep: python3
- Interaktivt objektorienteret højniveausprog - standardversion af Python 3
Download proteinortho
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| m68k (unofficial port) | 207.1 kB | 771.0 kB | [list of files] |