[ forky ]
[ sid ]
[ Source: bwa-mem2 ]
Package: bwa-mem2 (2.2.1-1 and others)
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Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
allineamento di sequenze usando la trasformata di Burrows-Wheeler
BWA è un pacchetto software per mappare sequenze con bassa divergenza rispetto a vasti genomi di riferimento, come il genoma umano. Consiste di tre algoritmi: BWA-backtrack, BWA-SW e BWA-MEM. Il primo è progettato per sequenze Illumina fino a 100pb, mentre gli altri due per sequenze più lunghe da 70pb a 1Mpb. BWA-MEM e BWA-SH condividono funzionalità simili, come gestione per lunghe sequenze e allineamenti spezzati, ma BWA-MEM, che è il più recente, è generalmente quello raccomandato per interrogazioni di alta qualità perché più veloce e più accurato. BWA-MEM ha prestazioni migliori anche rispetto a BWA-backtrack per sequenze Illumina 70-100pb.
Other Packages Related to bwa-mem2
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- dep: libc6 (>= 2.38)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
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- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
Download bwa-mem2
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.2.1-1+b1 | 359.9 kB | 1,763.0 kB | [list of files] |
| i386 | 2.2.1-1 | 413.8 kB | 1,972.0 kB | [list of files] |