[ forky ]
[ sid ]
[ Source: bwa-mem2 ]
Package: bwa-mem2 (2.2.1-1 and others)
Links for bwa-mem2
Debian Resources:
Download Source Package bwa-mem2:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
Sekvenssammenligning via Burrows-Wheeler Transform
Burrows-Wheeler Aligner (BWA) er en programpakke, for oversættelse af lavafvigende sekvenser mod en stor referencearvemasse, såsom den menneskelige arvemasse. Den består af tre algoritmer: BWA-backtrack, BWA-SW og BWA-MEM. Den første algoritme er designet for Illunina-sekvenslæsninger op til 100 bp, mens de sidste to er for længere sekvenser fra 70 bp til 1 Mbp. BWA-MEM og BWA-SW deler funktioner såsom understøttelse af long-read og opdelingssammenligning, men BWA-MEM, som er den seneste, anbefales generelt for højkvalitets forespørgsler, da den er hurtigere og mere præcis. BWA-MEM har også bedre ydelse end BWA-backtrack for 70-100 bp Illumina-læsninger.
Other Packages Related to bwa-mem2
|
|
|
|
-
- dep: libc6 (>= 2.38)
- GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
also a virtual package provided by libc6-udeb
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]
- GCC støttebibliotek
- dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1)
- GNU Standard C++ bibliotek v3
-
- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- Komprimeringsbibliotek - kørselstid
Download bwa-mem2
| Architecture | Version | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|---|
| amd64 | 2.2.1-1+b1 | 359.9 kB | 1,763.0 kB | [list of files] |
| i386 | 2.2.1-1 | 413.8 kB | 1,972.0 kB | [list of files] |