[ Source: sibelia ]
Package: sibelia (3.0.7+dfsg-4)
Links for sibelia
Debian Resources:
Download Source Package sibelia:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioinf.spbau.ru]
Similar packages:
Experimental package
Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.
strumento per genomica comparativa
Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) è uno strumento per genomica comparativa: assiste i biologi nell'analisi di variazioni genomiche che correlano con patogeni o dei cambiamenti genomici che aiutano i microorganismi ad adattarsi ad ambienti diversi. Sibelia è anche d'aiuto per gli studi evoluzionistici e di riarrangiamento genomico per ceppi multipli di microorganismi.
Sibelia è utile per trovare:
1) regioni condivise; 2) regioni che sono presenti in un gruppo di genomi, ma non in altri; 3) riarrangiamenti che trasformano un genoma in altri genomi.
Other Packages Related to sibelia
|
|
|
|
-
- dep: lagan
- strumento estremamente parametrizzabile per allineamento globale di coppia di sequenze genomiche
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, loong64, sh4]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
-
- dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)
- fast suffix array construction
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not alpha, armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64]
- libreria di supporto a GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- libreria di supporto a GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]
- libreria GNU Standard C++, versione 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [not m68k]
-
- dep: python3
- linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)
-
- sug: sibelia-examples
- strumento per genomica comparativa (dati d'esempio)
Download sibelia
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 306.7 kB | 1,295.0 kB | [list of files] |
| amd64 | 329.2 kB | 1,232.0 kB | [list of files] |
| arm64 | 292.5 kB | 1,228.0 kB | [list of files] |
| armel | 293.8 kB | 1,171.0 kB | [list of files] |
| armhf | 299.1 kB | 967.0 kB | [list of files] |
| hppa (unofficial port) | 296.3 kB | 1,059.0 kB | [list of files] |
| i386 | 342.2 kB | 1,223.0 kB | [list of files] |
| loong64 (unofficial port) | 296.9 kB | 1,164.0 kB | [list of files] |
| m68k (unofficial port) | 317.8 kB | 1,347.0 kB | [list of files] |
| mips64el | 288.0 kB | 1,255.0 kB | [list of files] |
| ppc64 (unofficial port) | 311.4 kB | 1,292.0 kB | [list of files] |
| ppc64el | 315.0 kB | 1,228.0 kB | [list of files] |
| riscv64 | 308.1 kB | 1,056.0 kB | [list of files] |
| s390x | 316.6 kB | 1,148.0 kB | [list of files] |
| sh4 (unofficial port) | 358.6 kB | 1,164.0 kB | [list of files] |
| sparc64 (unofficial port) | 280.3 kB | 2,128.0 kB | [list of files] |
| x32 (unofficial port) | 331.3 kB | 1,175.0 kB | [list of files] |