[ Source: sibelia ]
Пакунок: sibelia (3.0.7+dfsg-4)
Links for sibelia
Debian Resources:
Download Source Package sibelia:
Maintainers:
External Resources:
- Homepage [bioinf.spbau.ru]
Similar packages:
Експериментальний пакунок
Warning: This package is from the experimental distribution. That means it is likely unstable or buggy, and it may even cause data loss. Please be sure to consult the changelog and other possible documentation before using it.
comparative genomics tool
Sibelia (Synteny Block ExpLoration tool) is a comparative genomics tool: It assists biologists in analysing the genomic variations that correlate with pathogens, or the genomic changes that help microorganisms adapt in different environments. Sibelia will also be helpful for the evolutionary and genome rearrangement studies for multiple strains of microorganisms.
Sibelia is useful in finding:
1) shared regions, 2) regions that present in one group of genomes but not in others, 3) rearrangements that transform one genome to other genomes.
Інші пакунки пов'язані з sibelia
|
|
|
|
-
- dep: lagan
- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
-
- dep: libc6 (>= 2.34) [not alpha, loong64, sh4]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.40) [loong64, sh4]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
also a virtual package provided by libc6.1-udeb
-
- dep: libdivsufsort3 (>= 2.0.1)
- fast suffix array construction
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not alpha, armel, armhf, hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64]
- Допоміжна бібліотека GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]
- Допоміжна бібліотека GCC
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [m68k]
- Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3
- dep: libstdc++6 (>= 14) [not m68k]
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
-
- sug: sibelia-examples
- comparative genomics tool (example data)
Завантажити sibelia
| Архітектура | Розмір пакунка | Розмір після встановлення | Файли |
|---|---|---|---|
| alpha (unofficial port) | 306.7 kB | 1,295.0 kB | [список файлів] |
| amd64 | 329.2 kB | 1,232.0 kB | [список файлів] |
| arm64 | 292.5 kB | 1,228.0 kB | [список файлів] |
| armel | 293.8 kB | 1,171.0 kB | [список файлів] |
| armhf | 299.1 kB | 967.0 kB | [список файлів] |
| hppa (unofficial port) | 296.3 kB | 1,059.0 kB | [список файлів] |
| i386 | 342.2 kB | 1,223.0 kB | [список файлів] |
| loong64 (unofficial port) | 296.9 kB | 1,164.0 kB | [список файлів] |
| m68k (unofficial port) | 317.8 kB | 1,347.0 kB | [список файлів] |
| mips64el | 288.0 kB | 1,255.0 kB | [список файлів] |
| ppc64 (unofficial port) | 311.4 kB | 1,292.0 kB | [список файлів] |
| ppc64el | 315.0 kB | 1,228.0 kB | [список файлів] |
| riscv64 | 308.1 kB | 1,056.0 kB | [список файлів] |
| s390x | 316.6 kB | 1,148.0 kB | [список файлів] |
| sh4 (unofficial port) | 358.6 kB | 1,164.0 kB | [список файлів] |
| sparc64 (unofficial port) | 280.3 kB | 2,128.0 kB | [список файлів] |
| x32 (unofficial port) | 331.3 kB | 1,175.0 kB | [список файлів] |