Package: samtools (1.9-4)

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Charles Plessy (QA Page)
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External Resources:

Homepage [www.htslib.org]

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elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

Samtools è un insieme di utilità che manipolano allineamenti di sequenze di nucleotidi nel formato binario BAM. Importa ed esporta nei formati SAM (Sequence Alignment/Map - allineamento/mappa di sequenze) e CRAM ASCII, effettua ordinamenti, unioni e indicizzazioni e permette di rintracciare letture in qualsiasi regione in modo veloce. È stato progettato per funzionare su flussi di dati ed è in grado di aprire un file BAM o CRAM (non SAM) su un server FTP o HTTP remoto.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Networking: Client, Network Protocol: FTP, protocol::http, role::program, Scope: Utility, Interface Toolkit: Ncurses TUI, Purpose: use::analysing, use::calculating, Filtering, Works with: Biological Sequence

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rec: cwltool

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linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione Python 2)

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	432.3 kB	1,008.0 kB	[list of files]