[ buster ]
[ Source: htslib ]
Package: libhts2 (1.9-12~deb10u1)
Links for libhts2
Debian Resources:
Download Source Package htslib:
Maintainers:
- Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
- Charles Plessy (QA Page)
- Andreas Tille (QA Page)
- Michael R. Crusoe (QA Page)
External Resources:
- Homepage [github.com]
Similar packages:
libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
HTSlib è un'implementazione di una libreria C unificata per l'accesso a formati di file, come SAM (Sequence Alignment/Map), CRAM e VCF (Variant Call Format), comunemente usati per dati di sequenziamento ad alte prestazioni ed è la libreria principale utilizzata da samtools e bcftools. HTSlib dipende solamente da zlib. È noto che è compatibile con gcc, g++ e clang.
HTSlib implementa un indice BAM (SAM binario) generalizzato, con l'estensione di file "csi" (coordinate-sorted index). Il lettore di file HTSlib cerca prima il nuovo indice e poi quello vecchio, se il nuovo è assente.
Other Packages Related to libhts2
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- dep: libbz2-1.0
- libreria compressione file a ordinamento blocchi di alta qualità - runtime
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- dep: libc6 (>= 2.23)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libcurl3-gnutls (>= 7.18.0)
- libreria lato client facile da usare per il trasferimento di URL (versione GnuTLS)
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- dep: libdeflate0 (>= 1.0)
- compressione e decompressione veloci di buffer interi basate su DEFLATE
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- dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20120614)
- libreria per compressione in formato XZ
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- dep: libssl1.1 (>= 1.1.0)
- toolkit Secure Sockets Layer - librerie condivise
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- dep: zlib1g (>= 1:1.2.0)
- libreria di compressione - runtime
Download libhts2
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 298.2 kB | 744.0 kB | [list of files] |