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Package: fastx-toolkit (0.0.14-6)

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strumenti FASTQ/A per la pre-elaborazione di sequenze corte di nucleotidi

Il FASTX-Toolkit è una raccolta di strumenti a riga di comando per la pre-elaborazione di sequenze corte di nucleotidi nei formati FASTA e FASTQ, solitamente prodotte da macchine per il sequenziamento di prossima generazione. L'elaborazione principale di tali file FASTA/FASTQ è la mappatura (allineamento) delle sequenze con genomi di riferimento o altri database, usando programmi specializzati come BWA, Bowtie e molti altri. Tuttavia è a volte più produttivo pre-elaborare i file FASTA/FASTQ prima di mappare le sequenze ai genomi, manipolandole per produrre risultati di mappatura migliori. Gli strumenti FASTX-Toolkit effettuano alcuni di questi compiti di pre-elaborazione.

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