[ buster ]
[ ソース: fastx-toolkit ]
パッケージ: fastx-toolkit (0.0.14-6)
fastx-toolkit に関するリンク
Debian の資源:
fastx-toolkit ソースパッケージをダウンロード:
- [fastx-toolkit_0.0.14-6.dsc]
- [fastx-toolkit_0.0.14.orig.tar.gz]
- [fastx-toolkit_0.0.14-6.debian.tar.xz]
メンテナ:
外部の資源:
- ホームページ [hannonlab.cshl.edu]
類似のパッケージ:
FASTQ/A short nucleotide reads pre-processing tools
The FASTX-Toolkit is a collection of command line tools for preprocessing short nucleotide reads in FASTA and FASTQ formats, usually produced by Next-Generation sequencing machines. The main processing of such FASTA/FASTQ files is mapping (aligning) the sequences to reference genomes or other databases using specialized programs like BWA, Bowtie and many others. However, it is sometimes more productive to preprocess the FASTA/FASTQ files before mapping the sequences to the genome—manipulating the sequences to produce better mapping results. The FASTX-Toolkit tools perform some of these preprocessing tasks.
その他の fastx-toolkit 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14)
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libgd-graph-perl
- Graph Plotting Module for Perl 5
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- dep: libgtextutils0v5
- Gordon Text_utils library
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- dep: libperlio-gzip-perl
- module providing a PerlIO layer to gzip/gunzip
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3