[ Source: bio-eagle ]
Package: bio-eagle (2.4.1-1)
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- Homepage [data.broadinstitute.org]
Similar packages:
fasi di aplotipi con una coorte genotipizzata o usando un panel di riferimento con fase
Eagle stima la fase di aplotipo all'interno di una coorte genotipizzata o utilizzando un panel di riferimento con fase. L'idea di base dell'algoritmo Eagle1 è di imbrigliare l'identità per discendenza tra parenti distanti, che è pervasiva per campioni di dimensioni molto grandi ma rara tra campioni più piccoli, per identificare velocemente la fase usando un approccio per punteggio veloce. Al contrario l'algoritmo Eagle2 analizza un modello completamente probabilistico simile al modello diploide di Li-Stephens utilizzata dai precedenti metodi basati su HMM.
Notare: l'eseguibile è stato rinominato in bio-eagle a causa di un conflitto di nome. Leggere di più a riguardo in /usr/share/doc/bio-eagle/README.Debian.
Other Packages Related to bio-eagle
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- dep: libboost-iostreams1.67.0
- libreria Boost.Iostreams
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- dep: libboost-program-options1.67.0
- libreria per opzioni di programma per C++
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- dep: libc6 (>= 2.27)
- Libreria C GNU: librerie condivise
also a virtual package provided by libc6-udeb
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- dep: libgcc1 (>= 1:3.0)
- libreria di supporto a GCC
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- dep: libgomp1 (>= 4.9)
- libreria di supporto GOMP (GCC OpenMP)
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- dep: libhts2 (>= 1.4.1)
- libreria C per formati di dati di sequenziamento ad alte prestazioni
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- dep: libopenblas-base
- libreria BLAS (algebra lineare) ottimizzata (libreria condivisa)
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- dep: libstdc++6 (>= 5.2)
- libreria GNU Standard C++, versione 3
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
- libreria di compressione - runtime
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- rec: med-config (>= 2.1)
- pacchetto Debian Med di configurazione generale
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- sug: bio-eagle-examples
- esempi per bio-eagle
Download bio-eagle
| Architecture | Package Size | Installed Size | Files |
|---|---|---|---|
| amd64 | 217.5 kB | 625.0 kB | [list of files] |