Package: mafft (7.525-1)

Links for mafft

Debian Resources:

Download Source Package mafft:

Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [mafft.cbrc.jp]

Similar packages:

Programa de alineación múltiple para aminoácidos o secuencias de nucleótidos

MAFFT es un programa de alineación de secuencias múltiples que ofrece tres métodos orientados a la exactitud:

 * L-INS-i (probablemente el mas exacto, recomendado para secuencias <200;

método de refinamiento iterativo incorporando información de pares alineados locales),

 * G-INS-i (apropiado para secuencias de longitud similar, recomendado para

secuancias <200; método de refinamiento iterativo incorporando información de pares alineados globales),

 * E-INS-i (apropiado para secuencias que contienen grandes regiones no

alineables; recomendado para secuencias <200), y cinco métodos orientados a la rapidez:

 * FFT-NS-i (método de refinamiento iterativo; solo dos ciclos),
 * FFT-NS-i (método de refinamiento iterativo; máximo 1000 iteraciones),
 * FFT-NS-2 (rápido; método progresivo),
 * FFT-NS-1 (muy rápido, recomendado para secuencias >200; método

progresivo con un árbol guia aproximado),

 * NW-NS-PartTree-1 (recomendado para ~50,000 secuencias; método progresivo

con el algoritmo PartTree).

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Biological Sequence

Other Packages Related to mafft

depends

recommends

suggests

enhances

dep: libc6 (>= 2.34)

Biblioteca de C de GNU: Bibliotecas compartidas
also a virtual package provided by libc6-udeb
dep: perl

Lenguaje Práctico de Extracción e Informe de Larry Wall

rec: libwww-perl

Interfaz a la web sencilla y consistente
rec: lynx

navegador web clásico no gráfico (modo texto)
rec: ncbi-blast+

next generation suite of BLAST sequence search tools
rec: ruby

Interpreter of object-oriented scripting language Ruby (default version)

enh: t-coffee

Multiple Sequence Alignment

Download mafft

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,158.5 kB	13,589.0 kB	[list of files]
arm64	958.1 kB	12,416.0 kB	[list of files]
armhf	783.4 kB	9,145.0 kB	[list of files]
i386	1,010.4 kB	13,541.0 kB	[list of files]
ppc64el	1,028.2 kB	16,470.0 kB	[list of files]
riscv64	1,087.4 kB	9,730.0 kB	[list of files]
s390x	1,059.1 kB	15,720.0 kB	[list of files]