Package: mafft (7.505-1)

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Maintainers:

Debian Med Packaging Team (QA Page, Mail Archive)
Charles Plessy (QA Page)
Andreas Tille (QA Page)

External Resources:

Homepage [mafft.cbrc.jp]

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Programa de alineación múltiple para aminoácidos o secuencias de nucleótidos

MAFFT es un programa de alineación de secuencias múltiples que ofrece tres métodos orientados a la exactitud:

 * L-INS-i (probablemente el mas exacto, recomendado para secuencias <200;

método de refinamiento iterativo incorporando información de pares alineados locales),

 * G-INS-i (apropiado para secuencias de longitud similar, recomendado para

secuancias <200; método de refinamiento iterativo incorporando información de pares alineados globales),

 * E-INS-i (apropiado para secuencias que contienen grandes regiones no

alineables; recomendado para secuencias <200), y cinco métodos orientados a la rapidez:

 * FFT-NS-i (método de refinamiento iterativo; solo dos ciclos),
 * FFT-NS-i (método de refinamiento iterativo; máximo 1000 iteraciones),
 * FFT-NS-2 (rápido; método progresivo),
 * FFT-NS-1 (muy rápido, recomendado para secuencias >200; método

progresivo con un árbol guia aproximado),

 * NW-NS-PartTree-1 (recomendado para ~50,000 secuencias; método progresivo

con el algoritmo PartTree).

Tags: Biology: Clustal/ALN, Proteins, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Biological Sequence

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Multiple Sequence Alignment

Download mafft

Download for all available architectures
Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	1,052.5 kB	11,920.0 kB	[list of files]
arm64	911.0 kB	12,026.0 kB	[list of files]
armel	916.0 kB	12,403.0 kB	[list of files]
armhf	765.3 kB	9,139.0 kB	[list of files]
i386	983.3 kB	13,119.0 kB	[list of files]
mips64el	873.9 kB	14,427.0 kB	[list of files]
mipsel	932.1 kB	14,174.0 kB	[list of files]
ppc64el	1,019.2 kB	16,336.0 kB	[list of files]
s390x	891.0 kB	13,010.0 kB	[list of files]